La certificación en la norma ISO 9001:2000 de Calidad tiene como alcance el diseño, gestión e impartición de acciones formativas dirigidas a fomentar el empleo y la capacidad de trabajadores y empresas del sector metal. Esta certificación implica la implantación de un sistema de gestión de calidad tanto en los recursos humanos y organizativos de los que dispone la FLM, así como en los productos y servicios que proporciona. 

Por otra parte y como resultado de la preocupación por la problemática medioambiental, la Fundación Laboral del Metal también dispone de la certificación en la norma ISO 14001:2004, a través de la cual se ha implantado un conjunto de herramientas y documentos que permiten una gestión responsable desde el punto de vista medioambiental. La implantación de un Sistema de Gestión Medioambiental, garantiza un grado de compromiso por parte de la dirección de la organización definiendo áreas de responsabilidad, control sobre impactos ambientales, un programa de actividades, auditorías periódicas encaminadas a asegurar la mejora continua,etc.